circRNA结肠癌复发预测分子标记

时间:2020/7/25来源:本站原创作者:佚名 点击:
我国结直肠癌的发病率及死亡率逐年上升,复发与转移是引起患者死亡率增加的主要原因,然而现有的临床诊断技术手段并不能有效的预测复发风险。因此,探究适用于中期肠癌预后预测分子指标,有助于推动肠癌患者的精准诊疗。日前,一项发表在《EMBOMolMed》的来自医院徐瑞华研究团队的研究采用高通量测序数据系统的鉴定、筛选并验证了一批可用于中期结肠癌复发预测的circRNA,为预测中期结肠癌的术后复发和患者生存情况打下了基础。

主要研究者

徐瑞华:教授、博导,华南肿瘤学国家重点实验室主任,医院院长,中国抗癌协会副理事长,中国临床肿瘤学会副理事长,《CancerCommunications》主编。主要从事消化道肿瘤个体化治疗领域及抗癌药物研究,发表通讯作者SCI论文余篇,主持了国家重点研发计划、计划、国家自然科学基金重点项目等多项基金。

主要研究内容

差异分子筛选

通过转录组检测、生物信息学分析,qRT-PCR验证、采用机器学习LASSO-bagging的方法,经过筛选优化,获得了由4个circRNA构成的模型体系。

临床相关性分析

将筛选的circRNA进行线性组合,利用训练数据集构建基于circRNA预测中期结肠癌复发的分子标签cirScore。通过性能评估和患者样本对标签性能进行验证表明该指标可在结肠癌患者中有效区分高危复发组和低危复发组。

疾病进程影响研究

采用慢病毒在两个细胞系中稳定敲降了三个circRNA,结果显示细胞系迁移能力得到了显著抑制。体内实验中,通过向裸鼠尾静脉注射敲降其中一个circRNA的肠癌细胞发现其严重的肺转移得到了抑制。

该研究首次发现了一组由circRNA组成的分子标签用于中期肠癌的复发和预后预测,揭示circRNA在肠癌进展中扮演的重要角色。同时创新了基于机器学习的肠癌分子标记物筛选策略,为肠癌的精准诊疗提供了新的思路和新的方法。

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